MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 74014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011989	GCA	2	6	256515	256520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147241
5002	NC_011989	TGGC	2	8	256754	256761	0 %	25 %	50 %	25 %	222147242
5003	NC_011989	TGA	2	6	257010	257015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147242
5004	NC_011989	GGC	2	6	257054	257059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147242
5005	NC_011989	GAA	2	6	257096	257101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147242
5006	NC_011989	CGG	3	9	257256	257264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147242
5007	NC_011989	CGG	2	6	257290	257295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147242
5008	NC_011989	CCT	2	6	257418	257423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147242
5009	NC_011989	ATG	2	6	257460	257465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147242
5010	NC_011989	CCG	2	6	257532	257537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147242
5011	NC_011989	GC	3	6	257681	257686	0 %	0 %	50 %	50 %	222147242
5012	NC_011989	GCCA	2	8	257731	257738	25 %	0 %	25 %	50 %	222147242
5013	NC_011989	GGC	2	6	257828	257833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147242
5014	NC_011989	GCT	2	6	257881	257886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147242
5015	NC_011989	TGG	2	6	257901	257906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147242
5016	NC_011989	CGA	2	6	258022	258027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_011989	CGTGG	2	10	258069	258078	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5018	NC_011989	AGG	2	6	258197	258202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_011989	TGC	2	6	258222	258227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_011989	GCA	2	6	258287	258292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_011989	ATC	2	6	258383	258388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_011989	CGATG	2	10	258390	258399	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5023	NC_011989	ATC	2	6	258408	258413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_011989	GCC	2	6	258558	258563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147243
5025	NC_011989	TTTG	2	8	258604	258611	0 %	75 %	25 %	0 %	222147243
5026	NC_011989	TCA	2	6	258625	258630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147243
5027	NC_011989	TGG	2	6	258634	258639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147243
5028	NC_011989	GCGA	2	8	258649	258656	25 %	0 %	50 %	25 %	222147243
5029	NC_011989	ACA	2	6	258664	258669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147243
5030	NC_011989	GTGG	2	8	258747	258754	0 %	25 %	75 %	0 %	222147243
5031	NC_011989	CGT	2	6	258802	258807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147243
5032	NC_011989	TTG	2	6	258823	258828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147243
5033	NC_011989	GCC	2	6	258834	258839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147243
5034	NC_011989	CCA	2	6	258844	258849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147243
5035	NC_011989	CCG	2	6	258853	258858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147243
5036	NC_011989	A	6	6	258957	258962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_011989	GGC	2	6	258963	258968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_011989	GCC	2	6	258978	258983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5039	NC_011989	TCC	2	6	258986	258991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5040	NC_011989	ACG	2	6	259002	259007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_011989	ACG	2	6	259061	259066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147244
5042	NC_011989	CCA	2	6	259093	259098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147244
5043	NC_011989	CACC	2	8	259114	259121	25 %	0 %	0 %	75 %	222147244
5044	NC_011989	GC	3	6	259222	259227	0 %	0 %	50 %	50 %	222147244
5045	NC_011989	CGT	2	6	259361	259366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147244
5046	NC_011989	TGT	2	6	259387	259392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_011989	CCCAT	2	10	259483	259492	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5048	NC_011989	TCCA	2	8	259499	259506	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5049	NC_011989	AGC	2	6	259536	259541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_011989	GGCA	2	8	259592	259599	25 %	0 %	50 %	25 %	222147245
5051	NC_011989	CGG	2	6	259694	259699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147245
5052	NC_011989	A	7	7	259719	259725	100 %	0 %	0 %	0 %	222147245
5053	NC_011989	CCA	2	6	259732	259737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147245
5054	NC_011989	GA	3	6	259751	259756	50 %	0 %	50 %	0 %	222147245
5055	NC_011989	AGTCC	2	10	259787	259796	20 %	20 %	20 %	40 %	222147245
5056	NC_011989	CGT	2	6	259868	259873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147245
5057	NC_011989	GCC	2	6	259893	259898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147245
5058	NC_011989	CG	3	6	259935	259940	0 %	0 %	50 %	50 %	222147245
5059	NC_011989	ACC	2	6	260077	260082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147245
5060	NC_011989	CTG	2	6	260133	260138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147245
5061	NC_011989	AAG	2	6	260205	260210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147245
5062	NC_011989	AGG	2	6	260230	260235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147245
5063	NC_011989	TGC	2	6	260236	260241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147245
5064	NC_011989	GCG	2	6	260391	260396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147245
5065	NC_011989	GGTT	2	8	260407	260414	0 %	50 %	50 %	0 %	222147245
5066	NC_011989	AGCC	2	8	260452	260459	25 %	0 %	25 %	50 %	222147245
5067	NC_011989	TGG	2	6	260599	260604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147245
5068	NC_011989	GTC	2	6	260649	260654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147245
5069	NC_011989	ACG	2	6	260658	260663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147245
5070	NC_011989	GGA	2	6	260678	260683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147245
5071	NC_011989	GCG	2	6	260685	260690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147245
5072	NC_011989	TGC	2	6	260702	260707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147245
5073	NC_011989	GTGC	2	8	260781	260788	0 %	25 %	50 %	25 %	222147245
5074	NC_011989	CGG	2	6	260795	260800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147245
5075	NC_011989	CAGT	2	8	260816	260823	25 %	25 %	25 %	25 %	222147245
5076	NC_011989	GCC	2	6	261033	261038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147245
5077	NC_011989	CTG	2	6	261153	261158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147245
5078	NC_011989	GGC	2	6	261192	261197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147245
5079	NC_011989	TGCCGA	2	12	261230	261241	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222147245
5080	NC_011989	CAG	2	6	261294	261299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147245
5081	NC_011989	GTT	2	6	261300	261305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147245
5082	NC_011989	GAT	2	6	261320	261325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147245
5083	NC_011989	TGA	2	6	261334	261339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147245
5084	NC_011989	GGC	2	6	261356	261361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147245
5085	NC_011989	AGC	2	6	261380	261385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147245
5086	NC_011989	CAC	2	6	261449	261454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147245
5087	NC_011989	GAC	2	6	261474	261479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147245
5088	NC_011989	GAA	2	6	261491	261496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147245
5089	NC_011989	CGG	3	9	261503	261511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147245
5090	NC_011989	GTT	2	6	261575	261580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147245
5091	NC_011989	GAC	2	6	261620	261625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147245
5092	NC_011989	GAT	2	6	261626	261631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147245
5093	NC_011989	CAG	2	6	261633	261638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147245
5094	NC_011989	CCTGCC	2	12	261663	261674	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	222147245
5095	NC_011989	CCA	2	6	261702	261707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147245
5096	NC_011989	GC	3	6	261792	261797	0 %	0 %	50 %	50 %	222147245
5097	NC_011989	CGCC	2	8	261852	261859	0 %	0 %	25 %	75 %	222147245
5098	NC_011989	CCG	2	6	261900	261905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147245
5099	NC_011989	GCA	2	6	261916	261921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147245
5100	NC_011989	GGC	2	6	261987	261992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147245
5101	NC_011989	ACA	2	6	262022	262027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147245
5102	NC_011989	CG	3	6	262032	262037	0 %	0 %	50 %	50 %	222147245
5103	NC_011989	GCT	2	6	262064	262069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147245
5104	NC_011989	GCAA	2	8	262143	262150	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5105	NC_011989	TGCC	2	8	262151	262158	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5106	NC_011989	TGG	2	6	262247	262252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_011989	TA	3	6	262295	262300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_011989	GA	3	6	262402	262407	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_011989	GC	3	6	262507	262512	0 %	0 %	50 %	50 %	222147246
5110	NC_011989	TGG	2	6	262528	262533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147246
5111	NC_011989	CCA	2	6	262597	262602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147246
5112	NC_011989	GCC	2	6	262633	262638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147246
5113	NC_011989	ATC	2	6	262689	262694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147246
5114	NC_011989	GAT	2	6	262763	262768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147246
5115	NC_011989	AGA	2	6	262774	262779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147246
5116	NC_011989	TGC	2	6	262906	262911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147246
5117	NC_011989	CAT	2	6	262913	262918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147246
5118	NC_011989	GCT	3	9	262932	262940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147246
5119	NC_011989	GGT	2	6	262998	263003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147246
5120	NC_011989	TGAAG	2	10	263045	263054	40 %	20 %	40 %	0 %	222147246
5121	NC_011989	CCA	2	6	263056	263061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147246
5122	NC_011989	GGT	2	6	263079	263084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147246
5123	NC_011989	GCT	2	6	263118	263123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147246
5124	NC_011989	AAG	2	6	263130	263135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147246
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5126	NC_011989	GCTC	2	8	263165	263172	0 %	25 %	25 %	50 %	222147246
5127	NC_011989	AGG	2	6	263185	263190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147246
5128	NC_011989	CTG	2	6	263191	263196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147246
5129	NC_011989	TCG	2	6	263220	263225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147246
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5132	NC_011989	TGG	2	6	263320	263325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147246
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5134	NC_011989	TGA	2	6	263399	263404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147246
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5152	NC_011989	GAC	2	6	264075	264080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147246
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5183	NC_011989	AGGGCG	2	12	265510	265521	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	222147248
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5192	NC_011989	TTC	2	6	265923	265928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147248
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5195	NC_011989	AAT	2	6	265981	265986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222147249
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5200	NC_011989	T	6	6	266302	266307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5201	NC_011989	A	6	6	266373	266378	100 %	0 %	0 %	0 %	222147250
5202	NC_011989	TCA	2	6	266382	266387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147250
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5212	NC_011989	TCGA	2	8	266813	266820	25 %	25 %	25 %	25 %	222147250
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5224	NC_011989	CTG	2	6	267248	267253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147250
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5227	NC_011989	GCC	2	6	267332	267337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147250
5228	NC_011989	CGA	2	6	267343	267348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147250
5229	NC_011989	CGG	2	6	267388	267393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147250
5230	NC_011989	CAA	2	6	267514	267519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5231	NC_011989	GAA	2	6	267544	267549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147251
5232	NC_011989	CGG	2	6	267588	267593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147251
5233	NC_011989	CAG	2	6	267601	267606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147251
5234	NC_011989	GCC	2	6	267616	267621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147251
5235	NC_011989	GC	3	6	267653	267658	0 %	0 %	50 %	50 %	222147251
5236	NC_011989	TGC	2	6	267662	267667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147251
5237	NC_011989	GAC	2	6	267712	267717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147251
5238	NC_011989	CTG	2	6	267895	267900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147251
5239	NC_011989	TGC	2	6	267933	267938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147251
5240	NC_011989	ACA	2	6	267951	267956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147251
5241	NC_011989	GCC	2	6	267962	267967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147251
5242	NC_011989	GACCG	2	10	268029	268038	20 %	0 %	40 %	40 %	222147251
5243	NC_011989	GCC	2	6	268083	268088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147251
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5366	NC_011989	G	6	6	276094	276099	0 %	0 %	100 %	0 %	222147257
5367	NC_011989	GCC	3	9	276122	276130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147257
5368	NC_011989	TCA	2	6	276194	276199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147258
5369	NC_011989	CGC	2	6	276287	276292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147258
5370	NC_011989	GAT	2	6	276298	276303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147258
5371	NC_011989	CAC	2	6	276329	276334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147258
5372	NC_011989	GAC	2	6	276353	276358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147258
5373	NC_011989	TCA	2	6	276424	276429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147258
5374	NC_011989	CCGA	2	8	276459	276466	25 %	0 %	25 %	50 %	222147258
5375	NC_011989	GTG	2	6	276468	276473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147258
5376	NC_011989	CCGGG	2	10	276688	276697	0 %	0 %	60 %	40 %	222147258
5377	NC_011989	CAC	2	6	276727	276732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147258
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5380	NC_011989	GCC	2	6	276917	276922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147258
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5384	NC_011989	GCA	2	6	277018	277023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147258
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5387	NC_011989	TGGG	2	8	277071	277078	0 %	25 %	75 %	0 %	222147258
5388	NC_011989	GCCAGC	2	12	277104	277115	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222147258
5389	NC_011989	TGC	2	6	277121	277126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147258
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5394	NC_011989	TGA	2	6	277267	277272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147258
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5396	NC_011989	GC	3	6	277287	277292	0 %	0 %	50 %	50 %	222147258
5397	NC_011989	GCC	2	6	277296	277301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147258
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5400	NC_011989	TGCC	2	8	277381	277388	0 %	25 %	25 %	50 %	222147258
5401	NC_011989	GGC	2	6	277472	277477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147258
5402	NC_011989	ACC	2	6	277488	277493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147258
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5407	NC_011989	GGT	2	6	277770	277775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5409	NC_011989	TCGT	2	8	277856	277863	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5410	NC_011989	GA	3	6	277880	277885	50 %	0 %	50 %	0 %	222147259
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5463	NC_011989	CAT	2	6	281140	281145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5471	NC_011989	GCA	3	9	281401	281409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147262
5472	NC_011989	AGAT	2	8	281463	281470	50 %	25 %	25 %	0 %	222147262
5473	NC_011989	CGC	2	6	281512	281517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147262
5474	NC_011989	GGCCGG	2	12	281536	281547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147262
5475	NC_011989	AATG	2	8	281564	281571	50 %	25 %	25 %	0 %	222147262
5476	NC_011989	CCA	2	6	281638	281643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147262
5477	NC_011989	TTCATG	2	12	281646	281657	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222147262
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5484	NC_011989	CGA	2	6	281872	281877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147262
5485	NC_011989	CCG	2	6	281944	281949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147262
5486	NC_011989	CAG	2	6	282020	282025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147262
5487	NC_011989	CGC	2	6	282046	282051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147262
5488	NC_011989	CAC	2	6	282203	282208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147262
5489	NC_011989	GGA	2	6	282275	282280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147262
5490	NC_011989	AACC	2	8	282355	282362	50 %	0 %	0 %	50 %	222147262
5491	NC_011989	AAGG	2	8	282404	282411	50 %	0 %	50 %	0 %	222147262
5492	NC_011989	CGCGC	2	10	282664	282673	0 %	0 %	40 %	60 %	222147262
5493	NC_011989	GAT	2	6	282704	282709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147262
5494	NC_011989	A	6	6	282799	282804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5495	NC_011989	GCGG	2	8	282818	282825	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5496	NC_011989	GC	3	6	282999	283004	0 %	0 %	50 %	50 %	222147263
5497	NC_011989	CGG	2	6	283036	283041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147263
5498	NC_011989	GCC	2	6	283076	283081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147263
5499	NC_011989	GCAG	2	8	283137	283144	25 %	0 %	50 %	25 %	222147263
5500	NC_011989	GCG	2	6	283180	283185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147263

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